負(fù)責(zé)機關(guān)日常運轉(zhuǎn)工作，承擔(dān)信息、安全、保密、信訪、（）等工作。

水庫移民司

負(fù)責(zé)重大涉水違法事件的查處，協(xié)調(diào)和仲裁跨省、自治區(qū)、直轄市水事糾紛，指導(dǎo)（）和（）。依法負(fù)責(zé)水利行業(yè)安全生產(chǎn)工作，組織指導(dǎo)水庫、水電站大壩、農(nóng)村水電站的安全監(jiān)管。指導(dǎo)水利建設(shè)市場的監(jiān)督管理，組織實施水利工程建設(shè)的監(jiān)督。

監(jiān)督司

南水北調(diào)工程管理司

負(fù)責(zé)水文水資源監(jiān)測、國家水文站網(wǎng)建設(shè)和管理。對江河湖庫和地下水實施監(jiān)測，發(fā)布水文水資源信息、情報預(yù)報和國家水資源公報。按規(guī)定組織（）、（）和水資源承載能力監(jiān)測預(yù)警工作。

組織編制重要（）和重要（）的防御洪水抗御旱災(zāi)調(diào)度及應(yīng)急水量調(diào)度方案，按程序報批并組織實施。承擔(dān)防御洪水應(yīng)急搶險的技術(shù)支撐工作。承擔(dān)臺風(fēng)防御期間重要水工程調(diào)度工作。

擬訂節(jié)約用水政策，組織編制并協(xié)調(diào)實施節(jié)約用水規(guī)劃，組織指導(dǎo)（）工作。組織實施用水總量控制、用水效率控制、計劃用水和定額管理制度。指導(dǎo)和推動節(jié)水型社會建設(shè)工作。指導(dǎo)城市污水處理回用等非常規(guī)水源開發(fā)利用工作。

承辦部行政應(yīng)訴、行政復(fù)議和行政賠償工作。組織指導(dǎo)水政監(jiān)察和水行政執(zhí)法，（）水事糾紛，組織查處重大涉水違法事件。

指導(dǎo)水利設(shè)施的管理、保護和綜合利用，組織編制水庫運行調(diào)度規(guī)程，指導(dǎo)（）、水閘等水利工程的運行管理與劃界。