在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產生干擾。

離子色譜法測定無機陰離子時，不被色譜柱保留或弱保留的陰離子干擾F-和Cl-測定時，用強淋洗液進行洗脫。

為避免色譜柱容量的超載，在分析未知濃度的樣品時，最好先稀釋100倍進樣，或用微量進樣器進樣1-2ul，再根據所得結果選擇合適的稀釋倍數(shù)或進樣量，這樣既可以避免色譜柱容量超載，又可以減少強保留組分對柱子的污染。

采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，顆粒物濾膜實驗室空白試樣的制備是將與樣品采集同批次的空白濾膜帶至采樣現(xiàn)場，不采集顆粒物樣品，按照樣品的運輸和保存要求，與樣品一起帶回實驗室，按照與顆粒物濾膜試樣的制備相同步驟制備。

采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，每次采集樣品應至少帶兩套全程序空白樣品。將同批次裝好吸收液的吸收瓶帶至采樣現(xiàn)場，不與采樣器連接，采樣結束后帶回實驗室待測。

采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，降塵實驗室空白試樣是不稱取降塵樣品，按照與降塵試樣的制備相同步驟制備。

采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，若空白濾膜中待測離子含量高出方法檢出限時應棄去不要，重新取一張濾膜分析。

《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）規(guī)定，測定氯化氫所配的試劑均貯存于玻璃瓶中。

《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）中的水溶性陰離子是指環(huán)境空氣顆粒物樣品，在不加化學試劑的情況下用去離子水溶解的陰離子。

《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）的吸收液要臨用現(xiàn)配。